〈五心章〉：
率爾、尋求、決定、染淨、等流等五心，略以十二門分別：
一、列名；
二、辨相；
三、八識有無；
四、剎那多少；
五、亂不亂生；
六、諸心對辨；
七、初後廣略；
八、諸位闕具；
九、三性所收；
十、緣生總別；
十一、何量所攝；
十二、問答聊簡。
〈唯識義林〉：
本章出體從所觀、能觀體總說而建立「五重唯識觀」，所觀體為唯識，以一切法攝為自體，通觀有為、無為法，一切唯識故。
五重唯識觀：
一、遣虛存實識。
觀察遍計所執性唯有虛妄不實法所起，並沒有實體用，應觀遍計正遣空，於眾生有情來說遍計所執性實有，然實際上遍計所執性並沒有真實體故；觀查依他起性、圓成實性諸法體實有，「二智境界，應正存有，理有情無故」。
二、捨濫留純識。
雖然觀察事相、理相皆不離於識，然此八識心王內識有境有心，「心起必託內境生故」，但識說唯，不說唯境。
三、攝末歸本識。
八識心王心內所取境界一切顯然，八識心王內能取心作用也是如此。此見、相分俱依心識而有，「離識自體本，末法必無故」。
四、隱劣顯勝識。
八識心王心及心所俱能變現一切法，所以但說唯心，「非唯心所」。八識心王心王體殊勝於心所，心所依心王生，「隱劣不彰，唯顯勝法」。
五、遣相證性識。
「識言所表，具有理事，事為相用，遣而不取；理為性體，應求作證。」此中大義即為顯所遣能所二覺皆為依他起性，斷此染污性故，於所執之實蛇、實繩我、法不復生愛染，「非於依他以稱遣故，皆互除遣」。不是如依他起性執，於聖道位須斷除蛇、繩二覺，故能夠逐漸證入真實性，了達異生位幻生蛇覺空，而證悟實繩分。於證真觀位，照見勝義諦真實性理，而能後得智見俗諦事，理事二法既能了證彰顯，人我、法我便能止息。此即是一重所觀體。能觀唯識，並以別境慧攝為自體。
由四尋思、四如實智，如是皆同不可得故。《攝大乘論》說：「入所知相者，謂多聞熏習所依，非阿賴耶識所攝」者，此文唯舉無漏種子在彼位增名為聞熏，稱非藏識，非諸能觀皆唯是無漏法。不然的話，四尋思智應不是加行智。
然諸教唯識不過五種義：
一、境唯識，但說唯識所觀境者，皆境唯識。
二、教唯識，「由自心執著」等頌，《花嚴》、《深密》等說唯識教者，皆教唯識。
三、理唯識，《三十頌》言：「是諸識轉變，分別所分別，由此彼皆無，故一切唯識。」如是成立唯識道理，皆理唯識。
四、行唯識，「菩薩於定位」等頌，四種尋思、如實智等，皆行唯識。
五、果唯識，《佛地經》言：「大圓鏡智，諸處、境、識皆於中現。」
《如來功德莊嚴經》說：「如來無垢識，是淨無漏界，解脫一切障，圓鏡智相應。」
《唯識》亦說：「此即無漏界，不思議善常，安樂解脫身，大牟尼名法。」如是諸說，唯識得果，皆果唯識。這裡所說的五種唯識義，總攝一切唯識義皆盡。
唯識的唯又有三種義理：
一、簡持義，簡去遍計所執生法二我，持取依他、圓成，識相、識性。
二、決定義，謂俗事中，定有真理；真理中，定有俗事。識表之中，此二決定，顯無二取。
三、顯勝義，瞿波論師《二十唯識釋》說，此說唯識，但舉主勝，理兼心所，如言王來，非無臣佐。今此多取簡持解唯。
那麼，識呢？心也。由心能夠集起綵畫為主之根本故，所以經說「唯心」；八識心王分別了達之根本故，論稱為「唯識」。
或者經義通說因果義，總說「唯心」；論說唯在於因義，但稱為「唯識」。
識者，即是了別義。異生有情於因位中，識用強的緣故，說八識心王為唯，其義並無二。於能觀位中，智強識劣，倘若以此八識心王為境，既能明白一切法皆不離心，今為所觀，所以名為唯識。又不離於依主，故稱之為唯識；「決斷從能，故可依智」。
「攝法歸無為之主，故言一切法皆如也；攝法歸有為之主，故言諸法皆唯識；攝法歸簡擇之主，故言一切皆般若。」
至於所觀性者，
《攝大乘論》說：「如是菩薩悟入意言似義相故，悟入遍計所執性；悟入唯識故，悟入依他起性。若已滅除意言聞法熏習種類唯識之相，乃至爾時菩薩平等平等無分別智已得生起，悟入圓成實性。」
又說：「名事互為客，其性應尋思，於二亦當推，唯量及唯假。實智觀無義，唯有分別三，彼無故此無，是即入三性。」初半頌為悟入遍計所執性，次半頌悟入依他起性，後一頌悟入圓成實性。
《成唯識論》說：「非不見真如，而能了諸行，皆如幻事等，雖有而非真。」
其唯識觀通生空、法空二空觀：
四尋思、四如實智，通生、法空觀。為生空所依，但說觀於一切法；意求一切種智，而觀法空故；為於二空，能夠生起正解之故，法空觀必帶生空觀，論所說的緣故。
